intenta poner de que cuando hagas click en el boton te haga la funcion
Código PHP:
if (isset($_POST['nombreBoton'])) {
$nombre_carpeta =$_POST['caja'];
$dir= "C:";
$total=$dir.$nombre_carpeta;
if (!is_dir($total){
@mkdir($total, 0700);}
else{
echo "ya es un directorio ";
}
}