Ejecución Automática de Script cada X cantidad de tiempo

[aloqui]

Como te ha comentado usermax lo mejor es lanzar los comando .php controlados con el cron.

Con Javascript tambien lo puedes hacer, aunque necesitaras tener el PC encendido todo el tiempo que quieras mantener el lanzamiento de procesos, y todo el proceso es un poco "chapuza".
Por ejemplo en una página que solo conozcas tú (para que el proceso no lo inicie cualquiera) le pones las temporizaciones con javascript para que al cumplirse se invoque una funcion que llame a una pagina de tu web que en realidad es la que lanza el script.