Existe la sentencia EXPLAIN, que en tu caso se escribriría:
Código:
EXPLAIN SELECT *
FROM smf_members INNER JOIN smf_messages
ON smf_members.ID_MEMBER = smf_messages.ID_MEMBER;
Esta sentencia te devuelve una serie de datos respecto a cómo está realizando la consulta.
Sobre este punto, es mejor que leas el manual de referencia:
7.2.1. Sintaxis de EXPLAIN (Obtener información acerca de un SELECT)