cambia
Cita: echo "<input type='checkbox' name='proyectos' value='$fila[1]$i'>" . $fila[1] . "<br>";
por
Código PHP:
echo "<input type='checkbox' name='proyectos[]' value='$fila[1]$i'>" . $fila[1] . "<br>";
Depues en la pagina con la que obtienes el dato haces asi:
Código PHP:
foreach ($_POST['proyectos'] as $miValor)
{
//en cada pasada con $miValor tendras el value de cada elemento marcado
//haces lo que quieras con ese valor
}