si te entiendo bien..
te recomendaria hacer un bucle segun el numero de valores del arreglo(count($registros))
asi:
Cita: for($i=1;$i<count($registros);i++)
{
$updateSQL = "UPDATE url_jcce SET munic='$num[$i]', url='$url[$i]' WHERE id ='$registros[$i]'";
//visualizas la consulta para estar seguro
echo"$updateSQL<br>";
mysql_query($updateSQL)
}
ojala te sirva de algo....