PHP triad es un pre-instalador de Apache+PHP+Mysql (entre otras cosas ..)
Parece ser q PHP-Triad ( no se si tendrá otras opciones de instalación) te deja PHP corriendo como CGI ..
Tendras que cambiar la configuración de tu httpd.conf para usar PHP como Módulo ...
Lo mejor q puedes hacer es:
1) te buscas otro WAPM (Windows+Apache+PHP+Mysql) ..
El FoxServ creo q deja PHP como Módulo de apache
http://sourceforge.net/projects/foxserv/
2) Te bajas PHP de su sitio oficial
www.php.net -> sección downloads. Bajate el "zip package" .. eso contiene todo lo necesario para poder Instalar PHP como módulo de Apache. Incluida la documentación para instalar PHP como módulo de Apahe.
Por lo demas .. no te ha de afectar para nada (es mas mejorar) usar PHP como Módulo de Apache ... Tan solo acuerdate de ver las FAQ's de PHP antes de instalarlo (apartado register_globals) .. para que lo tengas en cuenta ...
Un saludo,