Saludos!
 
Asi es, primero nescecitas asegurarte de tener las librerias GD, ya que las tengas intenta esto. 
Crea la siguiente funcion en el archivo 
upload.php  Código PHP:
    <?php
function redimensionar($imagen, $nombre_imagen_asociada){
 //directorio donde se va la imagen
 $directorio = 'imagenes/' ;
 //limites de ancho y alto
 $nuevo_ancho = 100 ; 
 $nuevo_alto = 100 ; 
 //informacion de la imagen
 $info_imagen = getimagesize($imagen); 
 $alto = $info_imagen[1];
 $ancho = $info_imagen[0];
 $tipo_imagen = $info_imagen[2];
 //Determina las nuevas medidas
 if($ancho > $nuevo_ancho OR $alto > $nuevo_alto){ 
  if(($alto - $nuevo_alto) > ($ancho - $nuevo_ancho)){ 
   $nuevo_ancho = round($ancho * $nuevo_alto / $alto,0);
  }else{
   $nuevo_alto = round($alto * $nuevo_ancho / $ancho,0);
  }
 }else{ 
  //si la imagen es mas pequeña se queda igual
  $nuevo_alto = $alto; 
  $nuevo_ancho = $ancho; 
 } 
 //dependiendo del tipo de imagen usar diferente funcion
 switch ($tipo_imagen){ 
  case 1: //si es gif ... 
  $imagen_nueva = imagecreate($nuevo_ancho, $nuevo_alto);
  $imagen_vieja = imagecreatefromgif($imagen);
  //cambio de tamaño... 
  imagecopyresampled($imagen_nueva, $imagen_vieja, 0, 0, 0, 0, $nuevo_ancho, $nuevo_alto, $ancho, $alto); 
  if (!imagegif($imagen_nueva, $directorio . $nombre_imagen_asociada)) return false; 
  break; 
            
  case 2: //si es jpeg ... 
  $imagen_nueva = imagecreatetruecolor($nuevo_ancho, $nuevo_alto); 
  $imagen_vieja = imagecreatefromjpeg($imagen); 
  //cambio de tamaño... 
  imagecopyresampled($imagen_nueva, $imagen_vieja, 0, 0, 0, 0, $nuevo_ancho, $nuevo_alto, $ancho, $alto); 
  if (!imagejpeg($imagen_nueva, $directorio . $nombre_imagen_asociada)) return false; 
  break; 
            
  case 3: //si es png ... 
  $imagen_nueva = imagecreatetruecolor($nuevo_ancho, $nuevo_alto); 
  $imagen_vieja = imagecreatefrompng($imagen); 
  //cambio de tamaño... 
  imagecopyresampled($imagen_nueva, $imagen_vieja, 0, 0, 0, 0, $nuevo_ancho, $nuevo_alto, $ancho, $alto); 
  if (!imagepng($imagen_nueva, $directorio . $nombre_imagen_asociada)) return false; 
  break; 
 }
 return true; //si todo ha ido bien
} 
?>    
  Despues, al final de tu funcion de upload, ya que halla subido la imagen, aplicas la funcion anterior. 
 Código PHP:
    /// Supongamos que subiste la imagen al directorio "imagenes/"
/// y que el nombre de la imagen le diste el valor "$imagen"
redimensionar("imagenes/$imagen","nuevo_nombre.jpg"); 
    
  Bueno, pues espero que te funcione. Saludos!