No tengo ninguno a mano ahora mismo, pero el código que has puesto no está para nada indentado :).
Para mi estaría bien así:
Código:
<table>
<tr>
<td>HOLA</td>
</tr>
</table>
Realmente la página se muestra bien, valida correctamente y todo OK. Lo que me molesta es cuando miro el código fuente de la página en Firefox.
Por ejemplo, tu código en PHP+MYSQL yo lo pondría así:
Código:
echo "<table>"
."<tr>"
."<td>HOLA</td>"
."</tr>"
."</table>";
Un saludo