Hola, está bien lo que planteas, solo te falta ponerle comillas y listo.
Código PHP:
$proyecto = $_post['proyecto'];
include 'config.php';
include 'opendb.php';
mysql_select_db('bd_web_proy') or die('mysql_error()');
$query = 'CREATE TABLE '.$proyecto.' ( '.
'id int(6) unsigned NOT NULL auto_increment, '.
'PROYECTO VARCHAR(20) NOT NULL, '.
'LIDER VARCHAR(15) NOT NULL, '.
'INDICADOR VARCHAR(12) NOT NULL, '.
'EXTENSION VARCHAR(6) NOT NULL, '.
'REF_PRESUPUESTARIA VARCHAR(12) NOT NULL, '.
'CUENTA VARCHAR(10) NOT NULL, '.
'CLIENTE VARCHAR(15) NOT NULL, '.
'PUNTO_FOCAL VARCHAR(15) NOT NULL, '.
'ALCANCE_TOTAL VARCHAR(500) NOT NULL, '.
'ALCANCE_ANO VARCHAR(500) NOT NULL, '.
'PRIMARY KEY(id))'.
'TYPE=MyISAM PACK_KEYS=1';
$result = mysql_query($query);
Algo asi, creo.
Pruébalo y nos dices.