Que tal se indexan los subdominios?

[00siete]

Si su contenido estuviera muy relacionado yo utilizaría carpetas en lugar de subdominios, pero si como dices son "casi independientes" probablemente lo mejor sea como subdominios.
Sin embargo vas a tener trabajo extra en posicionamiento, pues según tengo entendido la mayoría de los buscadores los consideran casi como dominios diferentes por lo que tienes que conseguir enlaces, etc. para cada uno de ellos.