a ver... lo que pides es un tanto "general" por decirlo de alguna forma. Por tanto, mi respuesta quizás sea igual de general, aunque efectiva.
Si tienes en tu base de datos una tabla con el id de usuario, el nombre del archivo y su ruta puedes hacer lo siguiente:
$sql="SELECT * FROM tu_tabla WHERE id_usuario='$id'";
Obviamente asumimos que $id es la id del usuario que verá el listado.
Luego haces:
$consulta=mysql_query($sql);
while($archivo=mysql_fetch_assoc($consulta))
{
echo "<a href=\"".$archivo['ruta']."\">".$archivo['nombre_de_archivo']."</a>";
}
eso hace exactamente lo que quieres.. pero es 1 de las 10 millones de maneras de hacer lo que necesitas. No sé si será la mejor o la que más se adapte a tus necesidades, pero como no pusiste mayores datos es lo que te puedo ofrecer por ahora.