Código PHP:
$archivos = array();
foreach ($_POST as $key => $value)
{
if (!empty($value))
{
$archivos[$key] = $value;
}
}
Eso hará que los archivos del formulario estén en el arreglo
$archivos (LOS VACÍOS NO SE INCLUYEN)
Supongo que harán falta más ajustes, sobretodo porque no has mostrado tu código ni nada, pero espero te sirva de referencia
suerte