MySql para muchos registros?

[SARALAI]

Hola,
Estoy pasando las bases de datos que tengo actualmente a MySql. Pero un amigo me comenta que MySql no es lo idóneo para bases de datos con muchos registros.
La tabla más gorda que tengo, acumulando datos durante muchos años tiene aproximadamente 40.000 registros y ocupa unos 200 Megas. Las otras también tienen muchos registros, 10.000, 12.000, 2.000, pero ocupan mucho menos.

Os rogaría me aconsejarais si MySql funciona bien con los datos que os he dado, con vuestra experiencia me podeis ayudar a decidir antes de tener todo el trabajo y que luego no me valga.

Agradezco los consejos. Un saludo y gracias