Prueba así:
Código PHP:
<?php include ("encabezado.php");?>
<?php include ("connection1.php");?>
<?php
$CED = $_POST['CED'];
$query ="select * from empleado_fijo where CED='$CED'";
Pero antes de eso necesitaras mover tu input de tu formulario a que este dentro de las etiquetas <form> y </form>
Saludos.