Después del FROM van los nombres de las tablas, no de los campos. Supuse que sabías que lo de poner el nombre de la tabla era para indicar en el momento de considerar el valor del campo:
Código:
SELECT *
FROM empleado_fijo, empleado_contratado
WHERE EMPLEADO_CONTRATADO.CED = variable;
No te pongo código PHP porque esta sección es de Bases de Datos, y no se debe poner código de programación.
Es una regla del foro.
Respecto al USING, lee con atención el Manual de Referencia:
13.2.7.1. Sintaxis de JOIN. Y si aún tienes dudas, preguntame de nuevo...