Hola camilithu,
Lo ideal es que primero realizes la estructura HTML, y despues trates de agregarle el codigo PHP, para ciclar los colores puedes usar el operador de modulo de PHP para ver si el numero es par:
Código PHP:
$i = 0;
while( $row = mysql_fetch_array($resultado) ) {
$color = ( ( $i % 2 ) == 0 ? "color1" : "color2" );
echo $color;
$i++;
}
Saludos.