En un primer vistazo del código de tu página, te puedo decir un par de cosas:
1.- El menú primero (horizontal) lo has encajado en la tabla después de un tr sin td:
Cita: <table class="cuerpo" cellspacing=0 cellpadding=0 width="100%" height="100%"><tr><ul class="menu1">
lo cual no debe hacerse, ya que todo contenido de una tabla debe estar dentro de algún td.
2.- En el segundo menú, veo que has usado uno de los de las FAQ, pero donde yo ponía <!--[if lte IE 6] en los comentarios condicionales de cada subgrupo (igual o menor que el 6, porque en el 7 funciona sin problema), tu has puesto <!--[if IE], y creo que esto te dará problemas.
Corrige lo que te digo, si te parece, y vemos qué ocurre entonces.
Mikel.