En Outlook tendrías que crear 2 carpetas dentro de Carpetas Personales, una por cada dominio, y dentro de cada carpeta una para cada cuenta de correo, luego utilizar filtros para enviar los correos correspondientes a cada carpeta.
Ya probaste Mozilla Thunderbird (2.0.0.14), puedes tener una bandeja de entrada, salida, enviados independiente por cada cuenta
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