No creo que fuera conveniente bajar tanto de versión de MySQL. Depende de qué es lo que estés por hacer y si depende exclusivamente de MySQL o no.
Existen algunas bases de datos que puede que te sirvan:
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FireBird.
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SqlLite. Este también es un módulo MySQL que se puede incrustar como DLL y te permite independizar la base del motor de MySQL. Para la creación de las bases te permite redefinir la ubicación de la carpeta.
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Mimer. Es un motor que tiene una versión free hasta cierta cantidad de usuarios y otra verisión empresarial. Aún tiene una versión para W98 y la ventaja de poder manejar instancias de bases de datos externas, con código SQL de cada una.
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Postgre. Con la ventaja de ser Open Source.
Esto te puede servir.