Mira... suponiendo que tienes los registros en un arreglo, esto podria servir:
Código PHP:
//registro 1
$arr[0][0] = "00001010030102";
$arr[0][1] = "V";
$arr[0][2] = "0028037311601";
$arr[0][3] = "RUIZ";
//registro 2
$arr[1][0] = "00002010020102";
$arr[1][1] = "V";
$arr[1][2] = "0018037311601";
$arr[1][3] = "RODRIGUEZ";
//registro 3
$arr[2][0] = "00003010020102";
$arr[2][1] = "E";
$arr[2][2] = "0008037311601";
$arr[2][3] = "PEREZ";
$archivo = fopen("test.txt","a") or die("No se puede crear.");
for($a=0;$a<count($arr);$a++){
fputs($archivo, " ".$arr[$a][0]." ".$arr[$a][1]." ".$arr[$a][2]." ".$arr[$a][3]."");
fputs($archivo,"\r\n");
}
fputs($archivo," ...");
fclose($archivo);
print "Archivo creado";
Suerte!