Si tu servidor es Apache, lo que tienes que hacer es usar el rewrite_mod en un archivo llamado
.htaccess que lo tienes que ubicar en la raiz de tu sitio.
Prueba esto colocando en dicho archivo
Código:
Options +FollowSymLinks
RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^mi_dominio_uno.com [NC]
RewriteRule ^index.php index.php?site=dominio_uno [L]
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^mi_dominio_dos.com [NC]
RewriteRule ^index.php index.php?site=dominio_dos [L]
Eso te ejecuta la index diferenciadamente sin redireccionar.
Quizas te sirva. Si?