Deberias hacer un html index en el cual se carguen las demás secciones....
de esa manera podrás insertar un archivo flw (el reproductor) que reproduzca tantas canciones como quieras sin que al cambiar de sección deje de sonar o no funcione bien.
Espero haberte sido de ayuda
PSDT: Digo un flw porque por estetica quedan más personalizados, aunque también puedes insertar uno en codigo html de visualización tipo REAL PLAYER o WINDOWS MEDIA PLAYER.