Creando Graficos

[txiti]

Buenas estoy cogiendo datos de la BD y necesito llenar dos vectores en javaScript!!!alguien sabe que esta mal?no los llena!! aqui dejo el codigo muchas gracias!!!

<script language="javascript">
var notas= new Array();
var nombre= new Array();
<%
dniAlumno = (String) session.getAttribute("dniAlumno");
ControladorBD cbd = new ControladorBD();
String codGrupo=request.getParameter("codGrupo");
int codMateria=cbd.obtCodMateria(codGrupo,cbd.abrirCon exion());
try {
Connection pCon = cbd.abrirConexion();
String sql = "SELECT calificacion,nombreActividad FROM nota WHERE codMateria='"+codMateria+"' AND dniAlumno='"+dniAlumno+"';";
Statement stmt = pCon.createStatement();
ResultSet rs = stmt.executeQuery(sql);
if(!rs.next()){
out.println("No tiene actividades calificacadas");
}
else{
rs = stmt.executeQuery(sql);
int cont=0;
while(rs.next()){
String nombre = rs.getString("nombreActividad");
double nota = rs.getDouble("calificacion");
if((nombre.compareTo("Examen final")==0)||(nombre.compareTo("Examen parcial")==0)){
//no haga nada
}
else{//es una practica
String n="n"+cont;
String nom="nom"+cont;
%>
notas[]=<%out.println(n);%>
nombre[]=<%out.println(nom);%>

<%
cont++;
session.setAttribute("contador",cont);
}

}//fin del while
}//fin del else
} catch (SQLException ex) {
}
%>
</script>