Puedes hacer una referencia a la aplicación Excel.
Código PHP:
Dim xlsApp As Object
Dim xlsBook As Object
Set xlsApp = CreateObject("Excel.Application")
Set xlsBook = xlsApp.WorkBooks.Open("C:\Book.xls")
A partir de ahí podrás manejar el libro y la aplicación de forma fácil (como si estuvieras en VBA).