Vi tarde tu segundo mensaje... pero aquí dejo mi sugerencia de todas formas.
Código PHP:
$sql = "select idorden from ordenes";
$res = mysql_query($sql);
while ($row = mysql_fetch_array($res)) {
$idordenes = ",".$row[idorden];
$sqlcat = "select idorden from catering";
$rescat = mysql_query($sqlcat);
if(mysql_num_rows($rescat) > 0) {
// Orden con víaticos
$basura = mysql_result($rescat);
continue;
}
echo "Orden sin viáticos: {$row[idorden]}<br />";
}