Pues si tienes los datos en el ComboBox lo único que necesitas hacer es volver a guardar los datos que tiene ese ComboBox, y suponiendo que ya has eliminado el elemento con RemoveItem puedes guardar el ComboBox completo. Ejemplo:
Código PHP:
Dim Looping As Integer
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Open "Archivo.txt" For Output As #1
For Looping = 0 To Combo1.ListCount - 1
Print #1, Combo1.List(Looping)
Next Looping
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