Cita:
Iniciado por GreenEyed 
En realidad es una sola tabla, me da que fue un error de transcripción.
S!
Si, fue un error de dedo, una disculpa,
En tu tabla intermedia solo vas a tener como columnas los ids de cada tabla, en el ejemplo la tabla es materia_alumno y tiene como columnas idMateria e idAlumno
y las otras dos tablas que son Alumno y Materia, cada una va tener sus propias columnas.
saludos!