Bueno, finalmente lo he arreglado yo solito... no sé muy bien cómo, pero bueno. xD
Me he estado todo el dia trasteando con el código del index.php del template, hasta que al final ha cargado el flash y ha dejado de cargar la cabecera anterior. Incluso he logrado que no me descuadrase el template, cosa con la que también me había encontrado. Y ahora se ve, tanto en Explorer como en Firefox.
En fin... gracias por aguantarme.
Saludos.