Mira este ejemplo sencillo:
Código PHP:
<html>
<head>
<script language="javascript">
cuenta = 5;
function cuentaatras() {
document.getElementById('contador').value = cuenta + " seg.";
if (cuenta > 0) {
setTimeout("cuentaatras()", 1000);
} else {
alert("Cuenta atrás terminada");
}
cuenta = cuenta - 1
}
</script>
</head>
<body onload="cuentaatras()">
<input type="button" id="contador" value="5 seg." />
</body>
</html>