Amigo, no importa que sea SQL 2000 o 2005, ADO.NET esta preparado para trabajar desde SQL Server 7.0 hacia adelante, internamente en tu aplicacion es lo mismo, DATASET, DATATBLE, DATAVIEW. Para conectarte a sql Server lo unico que cambia es tu cadena de coneccion; hay diversas formas de conectarse y las encuentras en :
http://www.connectionstrings.com/