Hola, haber si intentas lo siguiente>
 
En lugar de poner>   
 Código HTML:
 <a href="javascript:popUp('frecuencias/<?php echo $row_Recordset1['canal2']; ?>.html')" class="menu"><?php echo $row_Recordset1['canal2']; ?></a>  cambia la extension de html a php y le agregas un parametro:  
javascript:popUp('frecuencias/<?php echo $row_Recordset1['canal2']; ?>.php?parametro=<?php echo $row_Recordset1['canal2']; ?>' 
Cambias parametro pon lo que quieras. Cosa que en la pagina php lo recibes con $_GET, algo asi:  
 Código PHP:
    $criterio=$_GET['parametro']:
$sql=mysql_query("select * from tabla where campo='$criterio'"); 
    
  
Espero te sirva de ayuda... 
SAludos