Aquí tienes informacion sobre ShellExecute:
http://msdn.microsoft.com/en-us/libr...53(VS.85).aspx
El último parámetro es el que te permite abrir la ventana maximizada (pasándole la constante SW_MAXIMIZE).
Aunque hay varios problemas de hacerlo de esa manera, primera, que es posible que el segundo programa (que simula los movimientos) se ejecute antes de que la ventana responda a los eventos por lo que fracasaría la acción.
Segundo, que, por ejemplo si se cambiara la resolución o cualquier otra cosa haga que los elementos no estén en la misma posición.
Lo que te recomendaría es que usaras SendMessage para controlar la otra aplicación, de hecho hace poco hablamos sobre su uso en otro tema.