Mejor y peor son solo palabras... todo depende de tus necesidades y el tiempo que dispongas.
Si decides separar el codigo y el html te recomiendo unar un motor de plantillas como Smarty.
La ventaja es que permite a alguien que no sepa php modificar el diseño.
Si eso es lo que necesitas, usalo!
Se te pone mas larga la cosa ya que tendrás que poner las plantillas aparte y asignar en el php los valores que vas a imprimir
Cita:
Iniciado por ealaequis 
O sea, GatorV, que puedo hacer las plantilas en HTML usando Dreamweaver, y luego aplicar dichas plantillas al archivo PHP. Yo estuve probando eso y funciona, pero mi pregunta iba orientada a como era mejor hacerlas.
A ver si me explico mejor: en DW cuando quiero comenzar a realizar una plantillas elijo Archivo/Nuevo y ahi, en la solapa de Pagina Basica, elijo Plantilla HTML. Otra opcion es elegir la solapa de Pagina de Plantilla y alli Plantilla PHP.
¿Existe alguna ventaja o desventaja en usar una u otra?
¿Es muy diferente crear una plantilla en PHP a lo que se hace en HTML?