Mmm... para enviar a muchas personas un mail y que no les aparezcan esas mil personas lo que se hace es enviar un mail con todos esos mails como "CCO" o "Con Copia Oculta"
PHP te da la opcion de enviar mails ya sea con BCC, CCO, etc... asi que yo creo que no tendras problemas jugando con las cabeceras.
Suerte!