Implementa esta función, a ver si hay suerte:
Código PHP:
function reemplazar($text, $words){
foreach ($words as $word){
$word = preg_quote($word);
$text = preg_replace("/\b($word)\b/i", '<strong">\1</strong>', $text);
}
return $text;
}
$palabras_que_buscar = explode($palabras);
echo reemplazar($texto_donde_buscar, $palabras_que_buscar);
Dinos si te funcionó