no se de donde sacaste la idea... pero estas completamente confundido...
Javascript ni siquiera tiene que ver con PHP ... son cosas distintas...
para llamar o ejecutar una función determinada, debes hacerlo desde un script PHP ... y ejecutar la función manualmente....
para esto, debes saber manejar variables externas... suerte!
Enlace:
http://www.php.net/variables.external
suerte!