Almacenar archivos de usuarios con nombre unico

[geq]

Si, verificar que el archivo no exista y si existe agregarle algún caracter, o un número al nombre del archivo, quizás.

Deberías ponerlo en un bucle de modo que si suben repetidas veces un archivo con el mismo nombre se vaya cambiando el nombre hasta que no exista.

O si no algo al azar, o que tenga que ver con el nombre de usuario, en el caso de que no sea importante conservar el nombre de archivo original.

Es decir, no tiene por qué el archivo en tu servidor tener el mismo nombre que el original.

Saludos.