De hecho sí hay maneras de activar/desactivar register_globals por medio de un archivo .htaccess (
Ver). Sin embargo generalmente se usa para hacer lo contrario (desactivarlas en vez de activarlas). No es bueno que te fíes de eso, pues representa un potencialmente enorme problema de seguridad. Además, a partir de PHP 6 ya no existirá esa directiva, y todos los scripts que hagan uso de ella deberán ser reescritos. Lee los siguientes links:
Manual de PHP: Uso de Register Globals MDW: ¿Qué nos espera con PHP 6? MDW: PHP4 y PHP5: ¿Cuál elegir? ¿Migrar o no Migrar? El advenimiento de PHP6 MDW: PHP4 y PHP5: El advenimiento de PHP6 (parte 2)
Saludos,
