Bueno al Final he logrado solucionarlo. Con un unión, gracias cala92 por la ayuda. He aqui la solucion:
Código:
SELECT e.Nomber, ue.ID_U
FROM e LEFT JOIN ue ON e.ID = ue.ID_E
WHERE ue.ID_U = 2
UNION
SELECt e.Nomber, NULL as ID_U
FROM e
WHERE e.ID NOT IN(SELECT ue.ID_E
FROM ue
WHERE ue.ID_U = 2)
Y el resultado es:
Nomber ID_U
Empresa1 2
Empresa2 NULL