Hola:
La respuesta es sencilla y tajante: No se pueden modificar cosas del sistema con javascript... lo único que podrías hacer es una simulación de esa alerta mostrando una capa centrada, pero dejaría de ser una ventana modal... te recomiendo que busques (si te interesa) en estos foros porque ya hemos implementado algunos scripts al respecto.
Saludos
