Cita: me da miedo que al ser un sistema tan utilizado, pueda llegar a tener problemas con los hackers.
Hay que tener cuidado con ese tipo de afirmaciones. Puede que un sistema muy popular y de código abierto como joomla, drupal o el mismo wordpress este en la mira de muchos hackers. Pero también tiene una gran comunidad.
Pensá que si hacés el sistema desde cero, toda la seguridad depende de vos (o del programador que contrates).
Suponé que algún alumno se pone a ver el sistema hecho a medida, y encuentra un agujero de seguridad... Vas a tener que llamar a tu programador, quizás volver a pagarle para que corrija. Y eso puede suceder muchas veces
Al usar un sistema como los antes mencionados, si bien están más expuestos, las correciones de seguridad son gratis. Algo muy importante al planificar el Costo Total de Mantenimiento del proyecto
Espero que mi punto de vista te pueda ayudar