Bueno definitivamente, e cambiado de opinion acerca de mi script, ya no me complico la vida, mas con el position fixed, pero es que ahroa tengo otro problema.
Como centro un elemento con position absolute, al centro de la ventana, si esta tiene scroll???
Poniendo los siguientes valores css, se me centra, si la página esta en lo mas alto del scroll:
Código HTML:
width: 800px;
height: 600px;
top: 50%;
left: 50%;
margin-left: -300px; // la mitad de la anchura
margin-top: -400px; // la mitad de la altura