En la web sugieres. Tu presentas tu diseño, el usuario lo ve. Si el usuario necesita cambiar el tamaño de la letra y tu diseño se desacomoda, ya no es cosa tuya. El usuario sabrá que es por su acción. Ahora, coincido con mikmoro, si el usuario tiene un tamaño predefinido, es por que lo necesita, cambiarlo es violar su derecho a decidir sobre sus cosas.
Ahora, cuando lees, hay que leer bien. Citando el articulo que mencionas joaquin:
Cita: which I’m using purely because it’s a nice round number for example purposes – 10px text is too small for the real world.
Eso esta hasta en negritas.
Es bueno asegurarse que nuestro diseño se ve bien si se aumenta o disminuye el tamaño de letra, pero hay que aceptar que hay caso en lo que simplemente hay que aceptar que en la web tu diseño es solo una sugerencia.