Hola,
No se si te entendí, pero pienso que entonces lo que debes hacer es lo siguiente:
El Rut será el dato que siempre estará en las dos planillas, entonces si el valor pagado por este Rut se repite en ambas podrás facturar, de lo contrario será un valor diferente:
Formula:
=SI(BUSCARV(A2;COBRANZAS!$1:$65536;4;0)=BUSCARV(A2 ;UNIVERSIDAD!$1:$65536;4;0);"Puedes facturar";"Valor diferente")
Bueno, espero haber entendido.
Chao.
