Deberías poder eliminarlos sin problemas. Son solo mensajes de error, es información para ti, no es que los ocupe el sistema.
Se supone consultar el log es porque la aplicación está en producción. Mientras esté en desarrollo es buena práctica hacer uso de un logger, manejar directivas de error_reporting(). Puede que te interese XDebug, es de lo más popular.
Un saludo