Si es que al reiniciar el sistema te sigue dando el menú para elegir con que sistema operativo iniciar, inicia desde la partición donde se encuentra el S.O. y sigue los pasos para
Editar el archivo Boot.ini ¡¡¡CUIDADO!!! estas líneas son muy importantes para el arranque del sistema, debes hacer una copia del Boot.ini antes de efectuar los pasos, todo se indica en el manual.