¿como ocultar una ventana que no sea de visual basic?

[boluart]

Haber... lo que quieres es ocular ventanas de aplicaciones externas a la tuya?
Si es asi: puedes usar algunas APIs de windows, para ello lo primero que debes hacer es obtener el handle (Identificador unico de la ventana) para poder ocultarlo, para ello puedes usar FindWindow, y para ocultarlo si no me equivoco puedes usar ShowWindow, claro que a esta ultima API tienes que pasarle el handle obtenido.
haber si este codigo te ayuda:

Código:

 
Private Declare Function FindWindow Lib "user32" Alias "FindWindowA" (ByVal lpClassName As String, ByVal lpWindowName As String) As Long
Private Declare Function ShowWindow Lib "user32" (ByVal hwnd As Long, ByVal nCmdShow As Long) As Long
Private Sub Command1_Click()
    'ocultar
    Dim mWnd As Long
    mWnd = FindWindow("Notepad", vbNullString)
    If mWnd <> 0 Then
        ShowWindow mWnd, 0
    End If
End Sub
Private Sub Command2_Click()
    'mostrar
    Dim mWnd As Long
    mWnd = FindWindow("Notepad", vbNullString)
    If mWnd <> 0 Then
        ShowWindow mWnd, 1
    End If
End Sub