que browser estas usando IE6, IE7, IE8 Beta, Firefox2, Firefox3, Opera, otro...
que antivirus usas, algunos traen opciones para bloquear pop ups, eso descontando que tengas algún programa especifico para esto
.
ahora son pop ups creados por ti, digamos estas haciendo una web con estas opciones o son pop ups de alguna pagina en particular.
es solo con los pop ups o con cualquier código javascript...