Bueno, parece que siempre se aprende algo
He investigado el funcionamiento de Gettext y sí, es correcta la forma de llamarlo, excepto por el segundo parámetro.
Lo que quiero decir es que ese segundo parámetro no es necesario. Incluso no he encontrado algo como lo que mostrás en los archivos de WordPress (aunque puede que se utilice solamente en los archivos del tema).
Con respecto a la variable, creo que sí puede causar un problema, al menos en todos los ejemplos que veo se utiliza sprintf() en vez de incluirlo así.
Prueba esto, que debería funcionar correctamente
Código PHP:
<?php comments_popup_link(__('Add your comment'), __('Read 1 comment'), __( 'Read % comment')); ?>
Saludos.