Primero, estás mezclando las cosas, pero ... si dices que no ... :-/.
Segundo, lo que Gator dice (y no hace falta que lo aclare) es que imprimir las URL de las direcciones de las imágenes (que nada tiene que ver con un include() de php), utilices rutas absolutas, osea, referenciadas desde la raíz del dominio, así no importa donde estés, siempre indicar todo el camino hacia el archivo.
Si tienes /imagenes/archivo.jpg
Y si haces referencia a esa URL desde dominio.algo/directorio/archivo.php o desde dominio.algo/archivo.php .. o desde donde sea, siempre va a apuntar al mismo archivo, ya que la ruta es absoluta, parte desde la raíz ... no hay pierde xD
Por útlimo ... solo respondo a los ejemplos que das. La verdad es que no me quedó muy claro lo que tienes en mente al hacer referencia al .htaccess y el index.php y la redirección ... :-/